施用生物有機肥可以改良土壤結構，為作物和土壤微生物的生長提供良好的營養和環境條件。雖然在土壤中多施生物有機肥不會像未成熟的有機肥那樣燒根燒苗，但并不是施的越多越好。這是因為作物產量的高低與土壤中養分含量低的一種養分有關。土壤中缺乏某種營養元素，即使有更多的其他營養元素，作物產量也不會再增加。只有補充土壤中的低限度的養分，才能提高作物產量。另外，當施肥量超過產量施肥量時，作物產量會隨著施肥量的增加而降低，生產投入成本增加但收益減少，這是不經濟的。因此，不能盲目大量施用生物有機肥，要根據不同作物的需要和土壤養分狀況，科學確定施肥量，以達到增產增收的目的。